Osnovni način rada radiofrekvencijskog identifikacijskog sustava podijeljen je na puni dvoetažni (Full Duplex) i polu dupleks (Half Duplex) sustav i sustav sekvenci (SEQ). Puni dupleks znači da radiofrekvencijsku oznaku i čitač mogu istovremeno međusobno prenositi informacije. Polu-dupleks znači da radiofrekvencijsku oznaku i čitač mogu prenositi informacije u oba smjera, ali mogu istovremeno prenositi informacije samo u jednom smjeru.
U full-duplex i polu-dupleks sustavima, odgovor radiofrekvencijske oznake šalje se pod elektromagnetskim poljem ili elektromagnetskim valom koji emitira čitatelj. Jer u usporedbi sa signalom samog čitača, signal radiofrekvencijske oznake vrlo je slab na antenu koja prima, pa se mora koristiti prikladna metoda prijenosa kako bi se signal radiofrekvencijske oznake razlikovao od signala čitača.